对越自卫反击战时，中国62式轻型坦克曾经以挂装裙板装甲和机枪防盾，栅栏的加强防护姿态参与山地作战。但在此后多年直至今日的新闻报道和军事节目中，国产坦克多半未出现裙板甲出击的画面，造成许多人误以为军工不重视坦克侧面防护的错觉。事实上99式和三代大改甚至96a式等坦克的锯齿形橡胶夹布裙板就可以对付大部分的步兵枪弹火力，如果换装国产的新裙板装甲（已研发成功），防弹片能力将会更为增强。
装有一门125毫米高膛压滑膛坦克炮，自动装弹机装填，[采用人工装弹时，射速1－2发/分]，坦克弹药基数为41发，[22发在自动装弹机内，19发放置在战斗室的各弹药箱中]，使用钨合金尾翼稳定脱壳穿甲弹时[初速为1780米/秒]，可在2000米距离上击穿850毫米的均质装甲，而使用特种合金穿甲弹时，同距离穿甲能力达960毫米以上，其弹芯长径比为30：1。为了进一步强化反坦克作战能力，99式改型主战坦克配备的多功能爆破榴弹为增强装药的高爆型，其威力较大，足以使当今主战坦克丧失战斗力。
还能发射中国仿制的俄125毫米口径炮射导弹（单车携装4枚），该导弹最大射程5。2公里，最大飞行速度达800米/秒，平均速度为500米/秒，从发射至到达最大射程处为8－－10秒，使该炮射导弹在战场上，也具有反击直升机的功能，最大破甲深度700毫米。辅助武器：为qjc88式12.7毫米高射机枪一挺，[备弹300发]对空中目标最大表尺射程1.5公里；86式7.62毫米并列机枪一挺，采用遥控电发，弹链供弹[备弹2000发]；火控系统，采用了国际上先进而流行的猎－歼式火控系统（也称双指挥式）其最显著的特点是，射击反应时间短，当静对静时小于等于5秒，静对动时小于等于7秒，动对动时小命中率可达百分之85以上，淘汰了不完善的大闭环式系统。另外车长还可以对火控系统进行超越（炮长的）控制，包括射击、跟踪目标和指示目标等；因此，就整体性能而言，三代大改主战坦克，这套火控系统已具备世界先进水平。
在坦克炮塔后部装有激光战场观瞄压制装置的改进版本（该设备未解密，也有观点认为这是一种未公开的主动防护设备而非99式的激光战场观瞄压制系统）。最大作用距离4000米，“激光压制观瞄系统”，就目前来看，相对于西方主要国家的主战坦克，我们的这套系统的确可以称得上是独具特色，激光压制观瞄系统由微机控制器、跟踪转台及随动系统、激光压制仪、热成像，干扰机[气体激光发射机]组成。为了实现车长，炮长遥控跟踪瞄准，对跟踪转台采用数字式位置闭环控制方式。该系统可360‘全方位工作：，俯仰角为－12”
－90度，*，跟踪角速度左右为45变/秒，俯仰40‘/秒。从炮长（或车长）按下按钮到系统对准一标只需1秒钟。激光输出能量为]，000兆焦，脉冲重复工作频率为10次/秒，系统连续工作时间为30分钟，激光器的寿命为120万次。
夜战能力方面：装有中国第二代凝视焦平面热成像仪，夜间或复杂气象条件下，对坦克目标观察距离达7－－9公里，平均无故障时间为4000小时，在能见度只有100米左右的恶劣环境中对目标的发现距离为4，000米，识别距离为3100米，在夜战能力上，已经对西方第三代主战坦克形成技术优势。具备了在昼/夜间于运动状态下对运动目标射击能力。
马力强劲，采用了具有世界先进水平的，国产150hb型，1103千瓦[1500马力]的涡轮增压中冷式大功率柴油机和
99式坦克新型高效传动系统，最大公路时速达80公里/小时，最大越野时速达60公里/小时（因
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