1866年国会选举之后，激进派稳固地掌握了两院的三分之二的多数，据此，激进派发动了进攻，在1867年2月，史蒂文斯以重建委员会的名义提出了第一个激进派的重建方案，这个法案很快就在众议院通过，但是在经过参议院时，遭到了必派的强烈反对，激进派无奈，只能与必派进行妥协，最终，双方达成妥协，法案将南部各州的政治重建分成了三步。第一步，除了田纳西州之外（田纳西州由激进派所控制），南部各州的州政府是不合法的，对于这些不合法的州政府，实行军管，将十个州分成了五个军管区。第二步，在不受种族、不受肤色、不受过去社会地位的选民选举产生各州的制宪代表大会，在合众国宪法的基础上制定各州的宪法；第三步，在指定的州宪法的基础上，产生议会和政府，在走完这三步之后，各州才能重新回到联邦，结束军管。
当时，在总统约翰逊的内阁成员中，只有陆军部长斯坦顿是支持激进派的，激进派为了保护他们在内阁中的唯一的盟友，国会还规定总统无权直接向军队下达命令，而且不经过参议院的同意，也无权罢免陆军上将的职务。国会的这一手可谓是釜底抽薪，有些架空了总统的权力。
当激进派的重建法案的已经公布之后，广大的人民群众都非车护，尤其是黑人们，都乐疯了。但是总统约翰逊却很恼火，利用手中的权力将该法案给否决了，但是国会是掌握在激进派的手里，国会又以超过三分之二的多数推翻了总统的否决。
在史蒂文斯提出的重建法案之后，又陆续通过了三个补充法案≮1867年3月通过的第一个补充法案规定，各州的军管局首先要做的是进行选民的登记和宣誓，在多数选民赞同的基础上，召开制宪会议制定州宪法‖年7月，第二个补充法案出台，该法案重申了军管局在各州的绝对权威≮1868年3月，最后一个补充法案规定，南部各州的新宪法只要得到实际参加投票人数的多数票支持即可生效♀些法案让约翰逊非常的不痛快，都利用总统的权力进行了否决，但是在掌握了国会三分之二多数的激进派面前，一切都是浮云。
在于总统的激烈斗争中，激进派取得了决定性的胜利，总统说的话估计就和放屁差不了多少了，整个局势掌握在激进派手中，他的重建法案得到了迅速推行。
虽然在激进派和总统约翰逊的斗争中占据了上风，但是总统约翰逊并没有坐以待毙，而是进行了反击。
首先，他认为国会通过的这些法案都违宪，既然我治不了，那就找人治，从而告到了高等法院，准备走司法程序。除此之外，他还把手伸向了军权≮1867年6月，约翰逊不顾军队指挥权法的规定，直接向南部5个军管区发布了旨在削弱军管区司令权力的命令，在此之后，又陆续解除了或调离了所有同情和支持激进派的军区司令≮1867年8月，约翰逊无视国会“未经参议院同意，无权凸或罢免陆军上将的职务”的法令，下令凸唯一支持激进派的内阁成员、陆军部长斯坦顿的职务，要格兰特滴陆军部长一职。但是斯坦顿寸步不让，拒绝离职，而约翰逊又坚持自己的意见～方互不相让，但是法令毕竟是法令，约翰逊只能在当年12月向国会递交了任免陆军部长的决定。参议两院可是激进派的地盘，结果可想而知，在来年1月，参议院正式拒绝了总统约翰逊的决定。格兰特也看清了形势，和约翰逊划清了界限，将陆军部长的职务交还给了斯坦顿。但是约翰逊不甘心失败，为了军权他又做出了一次努力，在1868年2月再次任命托马斯少将为临时陆军部长，但是斯坦顿稳如磐石，岿然不动〖翰逊控制陆军部的计划最终以失败告终。
约翰逊无视国会立法，尤其是两次无端下令免除斯坦顿的行为，着实惹恼了大部分的共和党议员，老虎不发威，你当我是病猫阿，国会因此决定对约翰逊进行反击
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